故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不…

偵探科二年級的遠山金次擁有某種神祕體質，在「某種契機下」會讓大腦細胞活性化，這一點他始終對眾人保密，只求能過平凡的校園生活。某天在上學途中他被捲入一起炸彈攻擊，因而和強襲科的超菁英──神崎‧Ｈ‧亞莉亞相遇。然後，Ｓ級的最…

《绯弹的亚莉亚》讲述一心向往普通人的平静生活，渴望能尽快从东京武侦高转走的少年远山金次，有个自初中毕业后一直隐藏的秘密。然而，只希望平静生活的他，却在一场骇人的自行车劫持事件中，邂逅了将改变自己人生轨迹的人物神崎H亚里亚…